City: Test Saint Petersburg Novosibirsk Kazan Language: Русский English

The analysis of molecular sequences (algorithms in Bioinformatics)
Kazan / autumn 2015, посмотреть все семестры

Enroll in the course to get notifications and to be able to submit home assignments.
Register to enroll now Login
TBA
Date and time Class|Name Venue|short Materials
09 September
13:35–15:05
Введение в биоинформатику. ДНК, мотивы, профили. Базовые алгоритмы поиска подстроки в строке, Lecture Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) No
09 September
15:20–16:50
Редакционное расстояние и выравнивание, белки, динамическое программирование. Попарное и множественное выравнивание. Выравнивание за линейную память, Lecture Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) No
10 September
13:35–15:05
Hidden Markov Models, поиск консервативных регионов (генов) в геноме, семейства белков, Lecture Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) No
10 September
15:20–16:50
Графы в биоинформатике. Сборка генома, сравнительная геномика, молекулярная эволюция, Lecture Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) No
11 September
13:35–15:05
Эффективные алгоритмы для поиска подстрок в строках. Хэши, Кнут-Моррис-Пратт, бор, Ахо-Корасик, суффиксные деревья и массивы, BWT, FM-index. Поиск с ошибками, Lecture Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) No
11 September
15:20–16:50
Principal component analysis и кластеризация. K-means и иерархическая кластеризация. Популяционная геномика, метагеномика, Lecture Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) No