Город: Санкт-Петербург Новосибирск Казань Язык: Русский English

Анализ молекулярных последовательностей (алгоритмы в биоинформатике)
Казань / осень 2015, посмотреть все семестры

Запишитесь на курс, чтобы получать уведомления и иметь возможность сдавать домашние задания. Для записи требуется регистрация на сайте.
Перейти к регистрации Войти
TBA
Дата и время Занятие Место Материалы
09 сентября
13:35–15:05
Введение в биоинформатику. ДНК, мотивы, профили. Базовые алгоритмы поиска подстроки в строке, Лекция Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) Нет
09 сентября
15:20–16:50
Редакционное расстояние и выравнивание, белки, динамическое программирование. Попарное и множественное выравнивание. Выравнивание за линейную память, Лекция Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) Нет
10 сентября
13:35–15:05
Hidden Markov Models, поиск консервативных регионов (генов) в геноме, семейства белков, Лекция Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) Нет
10 сентября
15:20–16:50
Графы в биоинформатике. Сборка генома, сравнительная геномика, молекулярная эволюция, Лекция Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) Нет
11 сентября
13:35–15:05
Эффективные алгоритмы для поиска подстрок в строках. Хэши, Кнут-Моррис-Пратт, бор, Ахо-Корасик, суффиксные деревья и массивы, BWT, FM-index. Поиск с ошибками, Лекция Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) Нет
11 сентября
15:20–16:50
Principal component analysis и кластеризация. K-means и иерархическая кластеризация. Популяционная геномика, метагеномика, Лекция Ул. Островского, д. 23 (Дом Сэлэт) Нет